靖难之变，对大明朝政治制度的影响，甚至超过了太祖朱元璋的国初肇建。
建文元年（公元1399年），燕王朱棣引用太祖《皇明祖训》中关于藩王权利的条款：“如国无正臣，内有奸恶，则亲王训兵待命，天子密诏诸王，统领镇兵讨平之。”，以“清君侧、靖国难”为口号，起兵叛乱。三年后，谷王朱橞（hui）打开金川门，帮助朱棣夺取了南京。朱元璋亲自指定的继承人建文皇帝或曰自杀，或曰失踪。朱棣自立为皇帝，年号永乐。此后大明的十位皇帝，全是朱棣的燕系子孙。
朱棣起兵的法律依据当然是苍白的。他没有建文密诏，也没有依制“讨平之后，收兵于营，王朝天子而还。”
本来朱棣进了南京，想抓住亲侄儿，然后逼迫他来个事后追认和禅让。哪知道建文更极端，一个火烧皇宫，让朱棣生不见人、死不见尸。这下那些不怕死的儒生们有话说了，比如蜀藩第一任世子傅方孝孺便是其中之一。方孝孺不仅拒绝起草朱棣的即位诏书，而且当众大骂朱棣为乱臣贼子，最后被恼羞成怒的朱棣灭了十族，还差点连累到蜀献王朱椿。
然而绝大多数的建文臣子还是决定继续在朱棣手下当官，为大明皇朝的稳定和谐继续尽绵薄之力。建文身死以后，太子朱标一脉只剩吴王朱允熥（tong）、衡王朱允熞（jian）。两人年纪尚幼，未能就藩，很快废为庶人，禁锢凤阳高墙。如此一来，朱棣不仅以武力控制了朝局，而且他的身份优势也凸显出来。
太子朱标、秦晋两王先后故去后，朱棣便是太祖朱元璋时存年纪最大的嫡子，即嫡长子，在血统上完全有继承大明皇位的资格。太祖《皇明祖训》中规定：凡朝廷无皇子，必兄终弟及，需立嫡母所生者。庶母所生，虽长不得立。庶子的政治权利与嫡子差别极大，根本没有皇位继承权。因此朱棣在靖难起兵之时，檄文中开篇即称他自己是高后马氏之后。即位之后，他更是再三宣称马后为生母。
然而这种说法很快遭到了时人的质疑。除了个别居心叵测者的流言外，质疑的主要证据是朱棣自己送上门的。
……
南京有座古刹，后毁于火灾。永乐十年，太监郑和（就是七下南洋那位）奉旨于原址重建大报恩寺。按宫阙规制，征集天下夫役工匠十余万人，耗银二百五十余万，历时十九年方才完工。大报恩寺内最有名的建筑，便是那座九级五色琉璃塔：楼高百余丈。飞檐下有金铃，塔心置篝灯。每遇风起，铃声不缀；一入暮色，光照百里。永乐御赐为“天下第一塔”。凡到南京之人，必去此处游玩。
此塔如此盛名，但是却有个奇怪的地方，让众多游人香客疑惑不已。因为塔下正殿之门经年关闭，从不让人上香膜拜。故而此塔究竟供奉何方神圣，便成了时人纷纷猜测的话题。顺着一些蛛丝马迹，官员和文人们逐渐发现，此塔供奉的很可能便是明成祖朱棣之生身父母。
朱棣的生母是谁？不是官方宣传的马皇后么？为什么不能正大光明，供人上香膜拜。偏要如此鬼魅，秘不示人？
内江王三大五粗的汉子，眼睛里却燃烧着熊熊的八卦之火：“小王听到传言，说南京有盗贼进到塔内，看见了供奉灵牌！后来便生出许多街谈巷议，说朱棣生母是个蒙古人！是元朝末帝妃子！”
“还有种更诡异说法，是个朝鲜女子李氏。”朱平槿打了个哈欠，侧身将烟卷灭了，补充道：“总之是汉夷混血，血统不正！”
“原来世子也知道，难道舒师傅这些也教你……”内江王和石泉老王一起恍然大悟。
见他俩对眼神，朱平槿笑笑提醒：燕王生母之事尚是谜团，如今也不到揭开之时。不过，不必光盯着别人家的事，蜀藩出身也不低么！
得了世子提醒，内江王顿时醍醐灌顶：“蜀、代、谷三王，本是同母兄弟（注一），皆出自郭惠妃。郭惠妃乃滁阳王（注二）与次妻小张夫人之亲女，而马氏不过为滁阳王之养女，身份只高不低！就凭我们身上有滁阳王血脉这一层，我蜀藩身份就比他燕藩贵重！他朱棣能凭刀枪入继大统，我蜀藩为何不能？如今燕藩一脉误了太祖传下来的花花江山，那他们还有什么脸面继续坐在那个位置上！”
“老朽所恨者，倒是京师的刻薄寡恩！”石泉老王跺着拐杖来帮腔，“你父王下葬，京师那个吝啬鬼竟然连一文钱也不给！平民百姓死了，买不起墓地棺材，街坊邻居还要凑几枚铜子，备床破席裹了，这才扔进化人场！你父王好歹也是亲藩国主！这钱能省么？这钱能省么？京师不要天家脸面，我们还要呢！好在世子纯孝，给了你父王风光大葬，也给我蜀藩挣回了脸面！要不然，外头那些官员百姓一定会说朱家快败了，天下要易姓了……”
石泉老王说话时怒不可遏，样子好似他百年之后，他的不肖子孙们把他的残躯用破席草编胡乱裹了，扔进化人场喂野狗。
朱平槿看看石泉老王，又瞧瞧内江王，心里点点头。该给他们说点实质性的东西了。朱平槿笑道：
“燕藩世系如何，如今尚不到穷究之时。宝塔扔在，将来找个机会进去看看，便可真相大白于天下。皇帝既是天子，上天若要惩罚皇帝，自然会有凶兆降下。本世子以为，天意叵测，人心难猜。我们与其坐等天意降下，不如趁早收拾人心，以顺天意。”
两位郡王