海战持续到了下午，监国舟山水师覆灭，此时赶到的清军汉军旗在固山额真的率领下已经在岱西登陆，其突破了张名振部的阻拦，率先控制了岱山港仓储区，那里储备着二十多万石走私粮和军粮，只是在包围了岱山城后才知道，鲁监国已经在张名振和张煌言的护送下，乘坐小船南下逃往了舟山岛，岳乐留下王之源围困岱山城，保护仓储区，等待定海将军张杰率领的第二波援军，而起率领水师和金砺的陆师直接南下舟山。
岱山岛遭袭的消息很快传开，第一个接到消息的是泗礁山的赵三刀和顾三二人，实际上，在这之前，其接到崇明要塞报讯，清军江南水师有出海之势，至于舟山黄斌卿、顾荣和沈廷扬部，已经不用岱山守军传信，隐藏在走私商人群体中的内奸和偷袭舰队已经焚烧了其十余艘战船。
赵三刀原本的计划是南下舟山援助，因为他得到的消息是，清军水师中有三十多艘大型桨帆战舰，赵三刀的第一个想法是，肯定是清军江南舰队在自己眼皮子底下溜过了江南舰队的警戒链，如果不能救援东南藩镇，那就是自己的失职，赵三刀丝毫不担心泗礁山，现在的泗礁山完全就是一个军事堡垒，棱堡和炮台组成的要塞群武装了这座小岛，港口也有诸多炮台保护，岛上还有一个守备营和两个大队的陆战队，一共三千四百多人马，此外还有千余来自江南、浙江的逃难百姓，在赵三刀的眼里，泗礁山谈不上万无一失，但绝对是舟山列岛之中最难啃的骨头，只有蠢货才会先动它。
整备完成的江南舰队出港南下不足半个时辰，就被通报船告知清军江南舰队二十多艘战舰来袭，赵三刀完全不相信，江南水师是他的老对手，有多少战舰他很清楚，什么时候有五十多艘桨帆战船了，但通报船带来的情报信誓旦旦，等赵三刀回援一看，果然不假，这个时候，他已经怀疑，是不是舟山那边报的假警讯，但不断逃来的明军也是信誓旦旦，赵三刀最终决定，自保为上，他一面派遣通报船向台北和济州通报，请求得到北洋舰队和海军部的支持，一面谋划对江南水师作战，赵三刀的意图很简单，只有解决眼前的敌人，才能抽身应对其他威胁。
按照当初李明勋调节的结果，舟山主岛属于黄斌卿，而沈廷扬与其交好，所以沈家的船队和军营也在舟山，只是此番大部分已经南下支援两广了，黄斌卿掌握舟山群岛最好的港口和位置，而舟山也可以屯田种植部分粮食，在走私和渔盐之利的帮助下，黄斌卿拥有一支不弱的船队和四千精锐的陆师部队，虽然人数在东南藩镇中算不上什么，但战力却是仅次于郑藩的，此番因为监国一脉抽调兵力太多，黄镇军队全在舟山驻扎，但四千精兵也照顾不来近五百平方公里的舟山岛。
岳乐把黄镇水师堵在了舟山港，而金砺则率军登陆，在取得了制海权之后，清军显的游刃有余，舟山港良好的地形和复杂的防御体系挡住了清军水师，岳乐冲击数次，损折了大小七艘船，最终选择放弃，而金砺的登陆部队却顺利上岛，并且在陆战中与金砺打了个平手。
黄镇与合众国交情很深，军中装配有陆军淘汰的重型火绳枪和轻型火炮，论战力是不弱于清军的，除了一开始的慌乱之外，在野战中两胜清军，但陈锦组织的援军已经来援，福建提督杨明高和右路总兵马得功一共一万三千人，乘坐搜罗来的各种船只登陆舟山，其以舟山走私粮为军粮，后勤压力骤降，此时舟山岛上清军四倍于明军，黄斌卿只得退守舟山城，与驻扎舟山的合众国要塞协同防御，黄斌卿还算仗义，即便监国君臣平日与其嫌隙丛生，但见监国一脉势穷来投，也是捐弃前嫌，护入舟山城中。
从岳乐率军进攻舟山群岛开始，到围困舟山城，一共只用了十天时间，在这个过程中，东南藩镇表现的堪称低劣，其号称的十数万大军多是屯垦的民兵，根本无从反击，在清军登陆之后大规模的投降，最后就连防守岱山城的一群勋贵、文臣也是向清军献城。
舟山大半沦丧，东南抗清局面一时崩溃。
东南崩溃，两广战场一时动荡，李明勋软硬兼施，震慑住了宵小之辈，安抚了异心之人，暂缓进攻，稳住局面，实际上，最想回援的是监国各藩镇，但其是有些无力，且不说这几部合兵也不过两万，根本不是清军对手，更重要的是其无船只，舟山藩镇南援多是出陆师相助，水师战船属于与之不睦的郑藩，如何能逆风北上援。
而真正动荡的是军心而非将心，原因很简单，将军勋贵们有权有势，其身处四战之地，而妻子儿女却多安置在合众国境内，许多将帅勋臣甚至连妻带子入了合众国的国籍，在台湾、吕宋购置田宅安置，而更多人则入股了婆罗洲开发公司，晋城打开局面后，许多将帅亲属都搬去了婆罗洲，只有那些文臣，整日把忠义仁孝挂在嘴边，一家老小都在舟山。
实际上，这群老夫子也想效仿勋贵们，做个‘大明裸官’，可惜的事与愿违，有人这么办了，不出五日就是上了台湾的报纸，弄的天下皆知，有些官员被舆lùn_gōng击，甚至于自杀，文官要脸，勋贵们却不在乎，所以勋贵可以干的，文官不能干，只是可惜，士兵家属多在舟山，此番已