当瞿式耜在桂林自杀的那一刻起，朱明朝廷已经事实上灭亡了，那位首辅大臣死的一点也不壮烈，孔有德攻入广西，军阀溃散，他有机会逃跑继续组织反抗的，但瞿式耜却对抗清事业失望了，选择留在桂林，被孔有德俘虏，坚持不降，一个月后死去，留下的不是气节也不过希望，只有和友人进行‘商业互吹’的几十首酸诗，当然，在文人的眼里，瞿式耜死的慷慨壮丽，青史留名，但却他没有选择对民族对国家最有利的方式。
瞿式耜死后，整个南明抗清在没有一支力量是由文官掌握的，掌握军队的只有藩王的军事集团，武将的家族团体和商人的利益集团，他们大多高举着大明的旗帜，却不会有任何一个人真的为朱明而战，无论是谁，真的光复中原，也会改朝换代，郑成功是这样，孙可望比他还不如，因为局势稍稍稳定，被溜须拍马之徒奉承的不知自己几斤几两的孙可望就想称帝了。
合众国与郑、孙两大政权注定是‘和而不同’，合众国可以与其进行一些合作，比如相约一起发动攻势，但也仅限于这般浅层次的合作，联盟只能奢望，而合众国也不会主动支持这些日后的敌人发展壮大。
李明勋默认了郑成功在舟山的主导权和继承原本属于监国一脉的东南战区，但在郑成功与合众国道不同不相为谋的情况下，李明勋是不会支持他发展的，实际上，郑成功对合众国最大的贡献就是在舟山发动比以往藩镇更强劲的攻势，牵制更多的抗清力量，至于其他，既不奢望也不需要。
两广会战的胜利更坚定的这一点，合众国通过与琼藩、晋藩的合作消灭了满勤一个重兵集团，只要再消灭两次或者三次，满清就彻底完蛋了，而合众国已经料理了海上威胁，并展开了轰轰烈烈的洲际贸易和印度洋贸易，可以说，这个国家已经进入有序发展状态，而不是用抢掠士绅、获得赔款等方式供养大规模的军队。
两广会战是吹响了反攻大陆的号角，使得合众国进入了一个有益的正循环，战胜胜利带来新的地盘和税源，新的税源会构建更强大更多的军队，而更强的军队会带来更多的地盘，如此滚雪球下去，早晚合众国不需要孙可望和郑成功来牵制满清，到那一日，这两股势力也就没有存在的必要了。
因此，李明勋对郑成功的态度非常强硬，打一顿只是开始，接下来的要求让延平藩着实始料未及。
在郑成功返回舟山之后，李明勋派遣使者解决东南变乱最后的问题，双方的矛盾在于黄镇、舟山藩镇和郑藩三大方面。
首先是黄镇，合众国没有揭露郑成功阴谋坑杀黄斌卿的事实，而是要求归还黄斌卿遗留的所有资产，黄斌卿死了，但是郑成功没有敢杀黄斌卿的妻子儿女，而黄斌卿的长子黄世爵此刻还在九龙地区开拓殖民地，无论是朱明的律法还是合众国的法律，黄斌卿的一切都应该由黄斌卿的妻、子继承。
财产方面，延平藩没有意见，关键是军队，黄斌卿的水师要么覆灭要么被顾荣带走，但陆师却有精兵四千，辅兵七千，加上家属近五万，但理论上这些是大明王师，所有延平藩要求全部留下，李明勋的对郑成功的态度是我说你做，没有商量的余地，而李明勋也没有想让黄世爵继承所有的军队和家属，这会引起九龙公司其他股东的不满，九龙目前也没有那么多地方安置，所以由合众国出面，派遣军队护送黄世爵和顾荣前去舟山，劝说士兵和家属前往九龙。
郑成功知道，自己不答应的话，至少也会被公开舟山的真相，甚至直接被合众国海军所灭，他只能答应，郑成功在延平藩说一不二，最终顾荣和黄世爵带走了一万七千人，其中有两千四百人的军队，延平藩在过去的时间里吞并了这些营伍，给了士兵相应的待遇，黄斌卿的影响力在下降，如果再过一年，或许不会有人跟着黄世爵走了。
黄镇的处置最终让郑成功措手不及，既然黄镇可以把士兵和家属带走，舟山藩镇同样可以，舟山各镇包括王之心在内，此刻还有一万五千人在香港等待东南变乱解决呢，这些藩镇也要求带自己的士兵的家属去南洋婆罗洲，因为婆罗洲大部分的股东都在其中，所以婆罗洲开发公司非常欢迎，虽然他们的家属被延平藩统治很久，但结果却完全不同。
舟山藩镇是士兵在外，家属在舟山，与黄镇士兵和家属都在舟山不同，而婆罗洲开发公司已经准备把撤退藩镇的士兵和家属全部安置在新占领的文莱地区，而且已经为士兵们划分了生产资料，村落是现成的，只不过都是高脚屋，土地也是熟田，只要挖掘沟渠，稍稍整治就能阡陌百里，所以对舟山藩镇士兵的家属来说，他们是前往南洋去享受安宁生活的，因此六万家属大部分选择下南洋，省的在舟山饱受战争之苦。
舟山本就只有丁口十三万，一下被带走了一大半，延平藩实力大损，这也与郑成功原本计划的，控制家属就能逼在粤士兵返回舟山的计划大相径庭。
但却不是全无好处，舟山狭小之地，本就安排不了多少人，而郑成功计划把藩下士兵在琉球的家属迁来，如今走了许多人，倒是空出来房子和土地了。
郑藩的问题则比较复杂了，虽然郑成功把责任全盘推卸给了已经叛变的施琅，但不可否认的是，郑成功派遣施琅南下金夏，才造成金夏失守，满清渔翁得利的局面，延平藩负