步骘在马家现行的三省制度当中，增加了不少改进的建议。其中，还对三省的机构人数，做了详细的论断，认为中书省负责秉承皇帝旨意起草诏敕，人数不宜过多。但又考虑到马家制度初创，需要不少精于政令之才的可能，建议中书省有七到九人便可。其中官职包括长官内史令一人，副舍人三人，另有左谏议大夫、左拾遗、左补阙各一人便可；
门下省负责纠核朝臣奏章，复审中书诏敕，如认为不当，可以封还和加以驳正，有谏诤之责。责任虽重，但人数与中书省相同为好，便于有针对性纠察复核。设长官纳言一人，副长官黄门侍郎二人，主要职官给事中三人，右谏议大夫、右拾遗、右补阙各一人。
而尚书省为最高行政机构，负责贯彻各种政令。对中央担任具体事务的六部及地方上的州、郡、县官有领导、监督之权。‘中书取旨，门下封驳，尚书奉而行之’，是三省分工原则，从而彼此制约，以掌管国家大政。
此机构人员颇多，设长官尚书令一人，副长官左、右仆射两人。仆射之下有左右丞、尚书、侍郎、左右司郎中、员外郎等人，负责都省职事，总领六部。各部长官称尚书，副为侍郎；而又因为尚书省权力过高，步骘建议，他们可以权重位轻，以此来削弱尚书省的影响力。
同时，六部之下，根据马家实际需要，设立各司，负责专门职事。各司之长为郎中，副为员外郎，以吏、户、礼、兵、刑、工六部职能，对州、郡、县进行领导监督。
总得来说，步骘完全理解了马超的意图。以三权分立、相互牵制又相互合作的原则，以无声无息的悄然改变为格调，以提高政府办事效率、平衡各部门关系为目的，创建出了马家这个划时代意义的三省六部制！