舰队以下设三大队，每大队一千人，设旅帅、旅长、把总各一人，大队以下设三分队，每分队三百三十人，设队长、队正、总旗各一人。分队下设三小队，每小队一百人，设小队长、小队正、小旗各一人。小队下设三班，每班三十人，设班长、班头、班副各一人，班下设三组，每组十人，设组长、副组长、小组长各一人。
陆军驻军分别设：南山、谷山、忠州、瀛州、本州、九州、西贡、古晋、汉山、爪哇十大营，陆军兵力定额为二十万，分别设八大战区：平壤战区、九州战区、瀛州战区、中都战区、爪哇战区、海市战区、勃泥战区、西贡战区。
平壤战区督军沈有容，九州战区督军王阿忠，瀛州战区督军骆尚志，中都战区督军陈冲，爪哇战区督军张那督，海市战区督军刘庆，渤泥战区督军童龙，西贡战区督军刘忠信（秋月忠信）。