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五月末发生的那次刺杀秦桧的事件，虽然在随着时间的推移逐渐为临安百姓们所淡忘，但是，这件事却在大宋朝堂之上掀起了轩然大波。秦桧三日未参与朝事，躺在家中静养，写给赵构的奏折说她虽无大碍，但惊吓过度，精疲神倦，实无法起身理事。又说：刺客行刺对他的惊吓倒不是最让他惊恐之事，他是为自己多年来为朝廷和大宋百姓鞠躬尽瘁呕心沥血，结果却成为别人攻击的对象而赶到伤心失望，他不理解为何自己如此的努力为大宋尽忠，却还要遭受这样的误解。
赵构自然是要宽慰秦桧的，目前朝政主事者便是秦桧，他若卧床不起，不理政务，朝廷便会变得乱糟糟的。有他在，朝廷的运转还是颇有条理的。他离不开秦桧，不能没有秦桧帮自己打理朝廷事务。于是乎赵构亲自前来秦府探望秦桧，抚慰他的心。
秦桧在病床上向赵构提出要严查幕后指使者，并且严惩的要求。他告诉赵构，根据他的判断，此事必有人幕后指使，他的理由很充分，那死去的刺客施全是殿前司的一名小校，此人原本是罪臣岳飞的岳家军中的低级将领。
当初岳家军解散之后，秦桧曾说过不能让用岳家军的将领和士兵，当就地遣散，但是朝廷担心遣散之后反而会闹出纰漏，所以没有采用秦桧的办法。此时此刻，秦桧又拿出这件事来说道，并且据此将目标直指容留岳家军并且选拔了一部分岳家军将士进入禁军之中的殿前司指挥使杨存中。
赵构吓了一跳，杨存中可是他绝对信任之人，此人勇武忠诚不容怀疑。绍兴十一年金人不肯和议，大军南下，金帅完颜宗弼手下大将韩常率领拐子马和铁浮屠不可一世，一路破城拔寨，气焰嚣张之极。当时正是杨存中率领长斧兵迎难而上，大破拐子马和铁浮屠的金军，力挫金军锐气，阻止了金军进一步南下。虽然后续因为冒进导致失败，但杨存中凭借此战打破了金军铁浮屠和拐子马不可战胜的神话，大大鼓舞了军民心气。即便并不希望和金人交战的赵构也是对他大加赞赏。之后便将其提拔调任京城，统领殿前司禁军。在宫中护卫近十年，全无差错，忠心耿耿，就在不久前，赵构还给他加了恭国公的国公高爵，以褒奖他忠心护主之功。
现在，秦桧居然将矛头指向杨存中，赵构显然不能容他乱来。赵构心里明白，杨存中为人耿直，一心向自己效忠，所以平日对秦桧可能有些怠慢，但这绝对不会成为杨存中按中指使人刺杀秦桧的理由。更何况，岳家军余部选拔进入禁军中的事情确实是杨存中的主意，可是他事前跟自己做了禀报并阐述了理由。岳家军纪律严明，作战勇猛，作为保护皇帝的禁军而言，就是需要这样的兵马才能在关键时候保护好皇上。而岳飞既死，如果任由岳家军落在其他人手上，则反而可能出大事。所以打散岳家军建制，调拨精兵如禁军之中控制在手里反而是两全其美之策。赵构对此大为赞许，是当面首肯了他的提议的，所以这件事不可能是杨存中在背后捣鬼。倘若杨存中要利用岳家军余部士兵刺杀秦桧，那又何必等这么多年？又怎么会暴露身份？
不过，此刻对秦桧可不能这么说，那会让秦桧认为自己责怪他胡乱攀诬。于是赵构对秦桧说，查幕后主使之人可以，但不能闹得满城风雨，更不能无凭无据，否则会乱了局面。至于杨存中，自己可以打包票他绝不会是幕后指使之人，自己可以让他上折子自承当初以岳家军兵马充入禁军的举动有欠考虑，但也仅此而已。
秦桧明白了赵构的意思，他本也没想扳倒杨存中，虽然他早就对这个对自己不屑一顾的家伙恨得牙痒痒。但他知道，杨存中深得官家信任，是官家控制禁军的一个抓手。自己想动这个人，那便等于是夺走皇上手上的刀，皇上不但不会听自己的，还会给自己来一刀。秦桧之所以要这么做，只是希望借此让赵构同意他调查幕后的主谋罢了。而这对秦桧而言更有实际的意义。
秦桧心里清楚的很，刺客行刺自己未必便有朝中官员主使。但这并不重要。自己受了这么大的惊吓，倘若不借此捞些东西话，那可太不值了。无论有无主谋，自己都要借此机会将朝中一些跟自己作对的家伙铲除几个，这才是正确的利用机会的方式。朝堂斗争经验丰富，权力倾轧手段老练的秦桧岂回浪费这样的好机会。
虽然满城搜查女刺客无果，但对秦桧而言，发动朝廷内部的查勘更为重要。调查很快便展开，从施全禁军的身份入手，先在殿前司军中展开了一系列的调查，并围绕施全接触的官员和将领进行了核查。秦桧本想着即便查不出什么来，也可以捏造一些证据，干掉几名自己想干掉的官员。但他没想到的是，查证居然有了收获。殿前司中一名副将和施全过从甚密，那副将被抓后更是供认不讳，并且牵扯出兵部主事赵恺，侍御史张孟普等数名朝中官员。进一步的顺藤摸瓜，外围居然又牵扯出数人，其中便有栖霞书院山长周钧正在内。
这一批官员平日便在一起密谋要扳倒秦桧，几名官员数次上奏弹劾秦桧未果，最终形成了以刺杀手段铲除秦桧的极端的办法。根据秦桧府第所在的方位以及车驾的习惯，安排了施全这个刺客在望仙桥路口刺杀秦桧。之所以选中施全，一则他武艺高强，二则此人曾是岳家军中张宪部的手下将领，岳飞和张宪风