日军第十三军仍驻上海，日军第六军驻在杭州，控制江、浙、皖等部分地区。
日军第十一军历任司令官是冈村宁次中将、园部和一郎中将、阿南惟几中将、横山勇中将、上月良夫中将；
日军第十三军历任司令官为西尾寿造大将、泽田茂中将、永津佐比季中将、松井太久郎中将。
日军第六方面军只有两任司令官，即冈村宁次大将和冈部直三郎大将。
1945年9月18日，日军第六方面军司令官冈部直三郎在武汉向中国第六战区司令长官孙蔚如投降。
1945年9月中旬，日军第十三军司令官松井太久郎第六军司令官十川次郎在上海向中国第三方面军总司令官汤恩伯投降。
五、华南地区日军。
1938年10月中旬，日军大本营为配合日军华中派遣军对武汉的攻势，并逐步切断中国政府从港澳地区的外援通道，成立以古庄干郎中将为军司令官的第二十一军，并在中国广东大亚湾地区登陆，很快占领广州，控制了两广部分地区。
1940年日军向越南进军时，第二十一军番号撤销，成立日军华南方面军。
1941年为准备太平洋战争，华南方面军撤销，在广州成立以酒井隆中将为司令官的第二十三军，占驻中国广东沿海、香港等地。
1945年9月16日，日军第二十三军司令官田中久一中将率其在中国广州、雷州半岛和海南岛地区的日军共8．3万人，在广州向中国陆军第二方面军总司令张发奎投降．
六、日军中国派遣军司令部。
此系1939年9月23日，由日军大本营下令组建的指挥中国关内战场上所有日军的最高指挥机构。
其目的是摆脱过去由日军大本营远离战地分别直接指挥各军经常造成失误的窘状，希望协调指挥中国关内各战场的所有日军，加快军事征服进程；
并配合中国各地伪政权等合流，组成统一伪政权的所谓“和平“攻势。
至1945年夏，日军中国派遣军统辖有：
在华北的华北方面军、在湘鄂赣等地的第六方面军，在江浙等地的第十三军、第六军，在两广及香港地区的第二十三军和日本海军中国方面舰队。
日军中国派遣军历次司令官为：
西尾寿造大将、烟俊六大将、冈村宁次大将。
1945年9月9日上午10时，日军中国派遣军总司令冈村宁次大将代表日军中国派遣军等部队在南京向中国政府投降。
日本陆军在第二次世界大战的最后时期总兵力已近600万，拥有200多个师团的番号。
其陆军常备主力师团下辖有两个步兵旅团，每个步兵旅团下辖两个步兵联队，每个步兵联队下辖三个步兵大队，每个步兵大队下辖四个步兵中队和一个重机枪中队，每个步兵中队下辖三个小队，每个小队约70人。
另外，师团还直辖骑兵联队、炮兵联队、工兵联队、辎重兵联队及通信队、卫生队，野战医院等。
一般齐装满员的日军常备主力陆军师团兵力往往可达2．4万人，拥有战马7630匹、步骑枪14900枝、掷弹筒144个、轻机枪288挺、重机枪54挺、山炮16门、野炮36门等武器装备，是具有多兵种配合的有强大战斗力的作战单位，故这种师团又被称为甲种师团.
日本陆军第一至第二十师团、近卫师团及中日战争爆发后由近卫师团扩编的近卫第二、第三师团，而后组建的战车第一、第二、第三师团和一度由常备主力师团的预备役部队编成的8个师团，均属于甲种师团的编制。
1938年后，由于日本军队在侵华战争中兵力消耗极大，其后组建的第二十一师团至第四十九师团均取消了旅团级建制，由师团直辖三个步兵联队，每个联队下辖三个步兵大队，同时指挥炮、工、骑、辎重兵联队等单位，全师团定员减至1．8万人，配备军马2065匹，步骑枪8940枝、掷弹筒216个、轻机枪216挺、重机枪54挺、平射炮18门、山炮12门等武器装备，这种类型的日军师团被称为乙种师团。
1941年太平洋战争爆发后，日军战线再度拉长，兵员更加缺乏，于是又开始缉建丙种师团。这种被称为丙种师团的部队又恢复了旅团建制，但取消了旅团下面的联队，即每个师团下辖两个旅团，每个旅团直辖四个步兵大队，全师团共八个步兵大队，加上师团直属的炮兵大队、工兵大队、辎重兵大队、通讯大队等单位，全师团定员1．3万人，配备军马2550匹，步骑枪6500枝、掷弹筒192个、轻机枪192挺、重机枪48挺、平射炮16门；迫击炮32门、野炮12门等武器装备，日军第五十师团至第一o九师团均属于这种编制的部队。
至1944年秋，盟军反攻迫近日本本土，日本为准备“本土决战“，又开始组建丁种师团。丁种师团的建制定员与丙种师团大致相同，只是特种兵和自动火器、重火器很少，番号在第一一o师团以后的各师团都是属于这种编制的师团。
另外，日本陆军部队中还有独立步兵混成旅团、独立警备队、骑兵旅团、野战重炮兵旅团等编制的部队。
步兵独立混成旅团下辖五个独立步兵大队及炮、工、通、辎重队，全旅团约8280人，配备军马1800匹、步骑枪4050枝、掷弹筒120个、轻机枪120挺、重机枪30挺、平射炮10门、山炮20门、野炮12门等武器装备，是具备相当野战能力的作战单位。
而日军独立警备队一般管辖六个独立步兵大队