刑风看着爱丽丝和克隆体将炸弹全部安放好后，和她们一起降到蜂巢最后一层，最后一层的大门打开，先是一个地下花园，跟着走道，他们来到了那间房间中。
刑风等人都拿着枪，警惕的走进房间之中，这时一个沉稳的声音传来“流浪的女儿终于回来了，快过来吧。”
刑风等人向声源处看去，看到了正坐在沙发上喝酒的艾萨克斯博士，一旁站着威斯克，也看到了地上躺着的、和艾萨克斯一模一样的尸体。
除了刑风外其他人都很吃惊，怎么会有两个艾萨克斯？威斯克还好解释，在阿卡迪亚见到的威斯克就是克隆体，眼前的不用说也是克隆体，那么这个艾萨克斯也是克隆体？
爱丽丝他们最先见到的艾萨克斯博士是在阿拉斯加，那时候是爱丽丝亲手杀了变成怪物的艾萨克斯，之后艾萨克斯就没有再出现过，她们还以为他已经死了。
艾萨克斯看着没有任何动作的众人微笑着说“别傻站着了，快过来吧，你们还剩半个多小时拯救世界了。”
爱丽丝端着枪走上前询问“你到底是谁？地上哪家伙是怎么回事？”
艾萨克斯笑了笑回答“这不很明显吗？只不过是解决了一个克隆体而已，我是真正的艾萨克斯博士！而其他的都只不过是我的克隆体，我将他们设计成只要认为自己是本体，就会更努力、斗争更久直到死亡。”
说完艾萨克斯端着酒杯来到爱丽丝的面前笑着说“生化人爱丽丝，你觉得你是真人？还是复制品呢？”
纯煳⑺蹩醋琶媲暗陌萨克斯质问道“你这是什么意思？我当然是本体！”
“呵呵呵爱丽丝，你太天真了。”
这时候有一个人坐在自动轮椅上来到众人的身后，所有人的目光都看向轮椅上的那人，是个年纪越有七八十岁的老太婆。
艾萨克斯看着她笑了笑走上前介绍道“让我想你们介绍一下——艾丽西娅马库斯，我以前的搭档詹姆斯的女儿，是保护伞公司的共同所有者，更是我的眼中钉！我现在就想除了她！”
艾丽西娅没有搭理艾萨克斯，而是看着爱丽丝说“爱丽丝，你的时间不多了，你必须快点杀了他！”
“太客气了，艾丽西娅让我来说明一下吧，这位女士也是t病毒的感染者，t病毒早在数年前就出现了，创造它的人正是她的父亲，詹姆斯。”
“詹姆斯为了救他这个患有早衰症的女儿，研制出了t病毒的原型，不过效果并不能持续太久，正如你们看到的，还是没有办法治好她，至今我还在等她死呢”
“后来，他发现了t病毒拥有很大的副作用，他打算停止病毒的研发，你们知道这会对保护伞公司造成多大的影响吗？所以...我杀了他！”
“后来我将t病毒交给了，同样女儿患有疾病的查尔斯博士，他也是个天才，虽然没有怎么改进t病毒，但研制出了中和剂。可惜我的要求不是这些，所以让人把他杀了。”
查尔斯博士就是安吉拉的父亲，当初保护伞确实绑架了他，原来他们是想杀了他，虽然最后不是保护伞杀的，但还是死了。
不过这样剧情就圆回来了。
不过爱丽丝可不管这些，她在意的还是自己的身份“我不是克隆人！”
“真的吗？你很疑惑吧，为什么你没有自己童年时候的记忆，没有你父亲、母亲的记忆？”
“我失忆了！”
“不，你没有那些记忆，是因为你没有经历过，你是在五年前被我们创造出来的！你只不是个木偶，是个聪明的复制品。”
“你在骗我！”
爱丽丝依旧不相信，而这时候红后出现，她看着爱丽丝解释道“他说的没错，你是通过艾丽西娅的年轻时的模样被创造出来的，我也是一样。”
说完红后的模样发生了变化，原本安吉拉的形象，变成了第六部电影中的形象“查尔斯博士用她女儿安吉拉的模样在我的原型上做了修改，这才是我原本的样子，你是年轻时候的样子，而我是幼年时期的样子。”
这时墙壁上的一个个屏幕上开始放映一段段艾丽西娅童年时期的录像“詹姆斯博士录制了她童年时期样貌与声音，创造出了我，而你是提取了她的基因制造出来的克隆人。”
“然后加以调整，以避免和她一样患上早衰症的折磨。你是她本该成为的女人。”红后的解释打破了爱丽丝最后的防线。
一只沉默的艾丽西娅这时候说话了“不，我永远也成不了像你一样勇敢的女人，你比我更强大，我太软弱了。”
“太感人了，可惜这又有什么用，一个瘫痪的老人，一个什么都做不了的人工智能，一个复制品，你们什么都改变不了。胜利者终将是我。”说到这他的脸上露出得意的笑容。
“好了，你们的问题我也回答了，现在把武器放下，放在地上。”
“我们为什么要听你的？”爱丽丝说完将枪举起，枪口对准了他的头。
艾萨克斯从衣服的口袋里掏出一个试管对着众人说“这就是你们想要的抗病毒素，可以终结这一切，可惜解药只有我这一瓶，你说如果我在这地下八百米的密封设施下打开它...那它还有用吗？”
“为了你们的梦想不会破灭，所以...你们最好把枪放下！”说完将试管在众人面前晃了晃，示意他真的会打开它。
“嗖！”突然一声破空响！只见一道黑影闪过，艾萨克斯用来显摆的试管不见了，