驻扎漳州厦门的明军水师陆陆续续拔锚启航，前往上川岛，并有五千陆师搭乘水师船只一同前往上川岛。这五千陆师都是精锐的火器兵，拥有两千燧发枪兵，一千战兵，一千辎重兵和一千辅兵，辅兵和辎重兵也全部配备鸟铳。这支陆师的主将是龚小大。这是一支按照新式军队编制的火器军。
王羽即将进行的军队改革，首先要改动的是辅兵和民壮。按照他的要求，辅兵将会进行详细分类，分别转化成运输辎重兵、工兵和医疗兵；民壮将会转成工程兵和铁道兵。
以后新式陆师的编制也会出现变化，镇的编制不变，镇长官为提督；镇下面设协，由总兵担任长官；协下面设标，由游击担任长官；标下面为营，由千总担任长官；营下面设队，由把总担任长官；队下面设排，原来的哨官变成排长；排下面设班，原来的什长变成班长，伍长转成下士，普通士卒分为上等兵和列兵。
不过目前进行战兵编制的改革还为时过早，龚小大的火器兵仍然按照原来的编制。
军功制度采取积分制度，不再以单兵所砍的人头来计算军功，这样可以避免作战的时候士卒们停止追杀敌人去砍地上的人头。至于收割人头，抓获俘虏，有专门的人员统计。
除了专门射杀对方高级军官的神枪手是以杀敌数量和所杀敌人的级别计算军功之外，其余的作战单位都是以集体计算军功，再根据单个士兵和军官在战斗中所起的作用来分配功劳。而非作战单位，也能计算军功，譬如说运输粮食，挖掘壕沟，打造攻城武器，都有集体的军功点可以分配。
这支火器军的主要任务是奇袭新会，切断广西清军同广东清军的联系。
拿下新会之后，由民壮和辅兵登陆新会，入驻城内，负责守城，龚小大的火器军再度登船前往广西登陆，配合白文选直接攻击清军的后路。
这就是拥有制海权的优势，只要不是台风季节，广阔的大海就任凭明军水师纵横。而在南方作战，台风季节其实也是双方停战的季节，当年南方的军队很少会在炎热的夏天开战，一般开战时机都是秋后开始到次年夏初。
也就在明军利用水师便利，往清军的西面调兵遣将的时候，一艘担负侦察任务的双体快帆船来到上川岛。
“红毛鬼的舰队出现在南海！很可能要来珠江口！”双体快帆船送来了情报。
接下来，双体快帆船又把这个紧急情报送到了漳州明军中军大营。
“红毛鬼舰队要进入南海了？”听到这个消息，王新宇顿时脸色大变，“我们夺取了红毛鬼的巴达维亚，这都没拖住他们？他们居然放弃了巴达维亚，直接往珠江口来了？这红毛鬼的舰队一来，可是对我们威胁很大啊！”
现在是对广东清军作战的关键时刻，明军的运输完全依赖海上运输。一旦被荷兰人的舰队进入南海和台湾海峡，将会对明军构成严重的威胁。按道理，英国人占领了纽约的消息已经送回荷兰国内了，怎么荷兰人的舰队还不回去呢？
这是当年通讯不便造成的，荷兰舰队指挥官德·奈特还不知道在西方发生的事情，也不知道英国已经向荷兰宣战。此时荷兰国内派来送信的快船才刚刚抵达巴达维亚，因为送信的船还不知道巴达维亚已经被明军占领，结果自投罗网，到了巴达维亚之后，这艘负责送信的快船就被胡德帝俘虏了。
经过审问，胡德帝才知道，这艘荷兰武装商船是给荷兰舰队送信的船，目的是要让荷兰舰队尽快离开远东，返回欧洲，投入到对英作战之中。
“看样子，我们得把红毛鬼放了，让他们把这个消息送去给他们的舰队，那对我们是有好处的！只要红毛鬼得到了这个消息，他们就会从南海撤军！”张玉坤思索了片刻说道。
胡德帝回答道：“现在放他们过去恐怕也来不及了！红毛鬼的舰队进入南海，恐怕已经威胁到我们水师的安全！”
荷兰人的舰队对明军的反清大业来讲，已经构成了极其严重的威胁。明军手头能够对付荷兰舰队的只有两艘快速桨帆巡航舰，而且是不能硬扛，只能远远的炮击。区区两艘船，根本无法保护得了庞大的中式水师船队。
浩瀚的南中国海海面上，大约距离澳门七百公里的珠江口以南海域，悬挂着荷兰国旗的庞大舰队正在海面上缓缓航行。因为风向不对，荷兰人的舰队只能走“之”字型路线，所以航速非常缓慢。
现在是冬季，刮的是西北风；而荷兰舰队是由南向正北航行，同风向的迎角过大，必须在海面上不断转向，利用侧后风来航行。
西式软帆船无法在太大迎角的侧前风情况下航行，也无法正侧风航行，从这一点来说不如中式硬帆。而王新宇设计的双体快帆船，却是在侧前风的情况下航速最快，因为那种船可以利用空气动力学原理，制造一个前后气压差来推动双体快船高速航行。
至于桨帆巡航舰，是中式硬帆和西式三角帆、前三角帆等相结合的中西合璧式船，在风向不顺的情况下一样可以航行，而且还有船桨动力。
最初设计桨帆战舰的时候，有人曾经提出过车船的方案。
所谓的车船，就是利用脚踩带动明轮，驱动船只在水上航行。早在唐朝末年就已经发明了车船，到了宋朝的时候，是车船的巅峰期，南宋水师一次次利用车船击败了北方金国的水师，保住了自己的半壁江山。