可孙传庭只用了四个月，就平定了陕西的叛乱。他的兵马都是自己组建的，朝廷也没给他发军饷，都得靠他自己去收税，这不得不说是个奇迹。
孙传庭坚持自己的意见，想要将自己这一路人马留在陕西。因为他觉得，陕西的民乱还没彻底平息，李自成还有十八人躲在山里，而张献忠手上还有好几万人马。
张献忠虽然暂时接受了招抚，但此人都不知被朝廷招安过多少回了，每次朝廷的兵马一调走，他就再次扯旗造反，是个不安定分子。
孙传庭认为，洪承畴已经回援京师了，若是自己再带人回去，张献忠搞不好又要造反了。
两年前，他灭了前“闯王”高迎祥后曾放出话来，说自己只要干掉李自成，就退休回家。因此，在陕西平乱的事情上，孙传庭是不会轻易让步的。
杨嗣昌和他持有不同意见，觉得守卫京师才是第一要务，陕西已经差不多了，根本就不需要留兵马驻守。
为此，俩人矛盾颇深。
有意见归有意见，朝廷的调令已经下来了，自然是要带人回去的。不过孙传庭的打算，是等见到了朱由检后，再提出带人回陕西的请求。
然而，他根本就没能见到朱由检，刚一到京郊，就收到了朱由检的旨意，不让他入京。同样是带人回京增援，洪承畴得以入京，还受到了朱由检的慰劳，他却没有。
不患寡而患不均，想必就是如此了。
孙传庭对朱由检这样的做法有些不满。
见不到朱由检，只能对杨嗣昌提意见了。可杨嗣昌的打算，是让他的兵马留下来守卫蓟辽，根本就不采纳他的意见。
孙传庭气得耳疾复发，最后向朝廷上疏，请求辞官回家。
杨嗣昌却没打算放过他，向朱由检进了他的谗言，说他这是在找借口推脱，不愿为朝廷继续效力。
朱由检大怒，随即下令，将孙传庭撤了职，下狱问罪。([m.2345xs.cc 2345小说网]。)